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蛋白质二级结构

一旦使用 X 射线晶体学或 NMR 解析蛋白质的 3D 结构，就可以根据其原子的 3D 坐标计算蛋白质二级结构。通常，DSSP是用于计算二级结构的工具，并将以下二级结构类型之一 ( https://swift.cmbi.umcn.nl/gv/dssp/index.html ) 分配给蛋白质中的每个氨基酸： C：循环和不规则元素（对应DSSP输出的空白字符） E: β - 链 H：α - 螺旋 B：β - 桥 G：3 - 螺旋 I：π - 螺旋 T：转弯 S：弯曲 然而，X 射线或核磁共振很昂贵。理想情况下，我们希望直接根据蛋白质的一级序列来预测其二级结构，这已经有很长的历史了。最近发表了一篇关于这一主题的评论，蛋白质二级结构预测的六十五年长征：最后的延伸？。